Wissenschaft mit Weitblick
Der Preis wurde für das 12 Jahre zuvor auf der „Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB)“ veröffentliche Paper „How Many Bootstrap Replicates are Necessary?“ verliehen. Entscheidend für diese Auszeichnung ist der große Einfluss der Arbeit auf die nachfolgende Forschung der computergestützten Molekularbiologie.
Die Wissenschaft entwickelt sich schnell. Neue Einflüsse stellen den bestehenden Wissensstand ständig in Frage. Bereits kurz nach Veröffentlichung, entstehen oft neue Problemstellungen und unterschiedliche Fragen, durch die neues Wissen entsteht.
Umso herausragender ist es, wenn Forschungsergebnisse auch Jahre nach ihrer Veröffentlichung einen hohen Einfluss auf die Arbeit und Entwicklung des Fachgebiets haben. Das Paper, welches Professor Alexandros Stamatakis gemeinsam mit Kollegen aus Deutschland, der Schweiz und den USA im Jahr 2009 veröffentlicht hat, wurde jetzt für genau diesen Weitblick und die Anwendbarkeit auch 12 Jahre nach Veröffentlichung ausgezeichnet.
Der vorgestellte Ansatz wurde 2009 direkt in einem Tool implementiert, welches für die Biologie bereits zur Stammbaumrekonstruktion genutzt wurde. Somit konnte die neue Methode sofort produktiv in der Forschung eingesetzt werden.
Der adaptive, pragmatische Ansatz der Arbeit, der darauf fokussiert, wie viel Signal in den empirischen molekularen Daten vorhanden ist, ermöglicht es nur so viele Berechnungen wie nötig durchzuführen, um stabile Ergebnisse zu erhalten. Dieses Verfahren führte zu einer starken Effizienzsteigerung in der Berechnung phylogenetischer Stammbäume.
Das Tool wurde weitere zehn Jahre durch Professor Stamatakis weiterentwickelt. Erst 2019 wurde es vollständig neu programmiert.
Link zum Paper: https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-642-02008-7_13
Stamatakis, der am Karlsruher Institut für Technologie (KIT) und am Heidelberger Institut für Theoretische Studien (HITS) tätig ist, entwickelt Software zur Analyse großer biologischer Datenmengen. Sein Forschungsschwerpunkt ist die Entwicklung skalierbarer Methoden und Software zur Analyse molekularer Daten. Stamatakis´ Publikationen beeinflussten damit die Evolutionsbiologie der letzten Jahre nachhaltig. Im Zentrum stehen dabei die Entwicklung von Software zur Berechnung evolutionärer Stammbäume, die Evaluierung und der Einsatz neuer paralleler Rechnerarchitekturen, die Evolution von Krebszellen und die statistische Klassifikation von Darmbakterien. Im Rahmen zweier internationaler Forschungsprojekte entschlüsselte er den Stammbaum der Vögel sowie den Stammbaum der Insekten.
Link zur Forschungsgruppe: https://cme.h-its.org/exelixis/
Der RECOMB „Test of Time Award“ 2021 wurde Professor Stamatakis und den Co-Autoren Nickolas D. Pattengale (University of New Mexico, USA), Masoud Alipour (EPFL, Switzerland), Olaf R. P. Bininda-Emonds (Universität Oldenburg) und Bernard M.R. Moret (Swiss Institute of Bioinformatics) im Rahmen der Konferenz RECOMB 2021 verliehen.